Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms