Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms