Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pole3Q9JKP7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pole3Q9JKP7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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