Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms