Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpa33Q9JKA5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpa33Q9JKA5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms