Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Alyref2Q9JJW6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Alyref2Q9JJW6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Alyref2Q9JJW6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Alyref2Q9JJW6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Alyref2Q9JJW6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Alyref2Q9JJW6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Alyref2Q9JJW6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Alyref2Q9JJW6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Alyref2Q9JJW6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Alyref2Q9JJW6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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