Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms