Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efcc1Q9JJF6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms