Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms