Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms