Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms