Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snap29Q9ERB0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snap29Q9ERB0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snap29Q9ERB0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snap29Q9ERB0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snap29Q9ERB0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snap29Q9ERB0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snap29Q9ERB0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snap29Q9ERB0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snap29Q9ERB0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snap29Q9ERB0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snap29Q9ERB0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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