Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms