Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms