Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tsc1Q9EP53 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tsc1Q9EP53 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tsc1Q9EP53 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tsc1Q9EP53 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsc1Q9EP53 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsc1Q9EP53 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsc1Q9EP53 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsc1Q9EP53 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tsc1Q9EP53 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tsc1Q9EP53 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tsc1Q9EP53 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms