Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ndufs3Q9DCT2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ndufs3Q9DCT2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ndufs3Q9DCT2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ndufs3Q9DCT2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ndufs3Q9DCT2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ndufs3Q9DCT2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufs3Q9DCT2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms