Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms