Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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