Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms