Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms