Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms