Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd8Q9DA37 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms