Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc70Q9D9B0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms