Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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