Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Alg13Q9D8C3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Alg13Q9D8C3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Alg13Q9D8C3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alg13Q9D8C3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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