Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Echdc3Q9D7J9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Echdc3Q9D7J9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms