Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Zcchc13Q9D548 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms