Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms