Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D454 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms