Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms