Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms