Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms