Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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