Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms