Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms