Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms