Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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