Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl11Q9CXW4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms