Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmpcbQ9CXT8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms