Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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