Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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