Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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