Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sycp2Q9CUU3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms