Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otud1Q9CUB6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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