Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms