Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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