Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms