Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl28Q9CR40 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl28Q9CR40 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms