Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms