Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms